Cụ thể, Cục Hải quan Đà Nẵng đạt 127,3% so với chỉ tiêu thu NSNN được giao, Cục Hải quan Khánh Hòa đạt 145,28%, Cục Hải quan Thừa Thiên Huế đạt 124,88%, Cục Hải quan Đắk Lắk đạt 145,81%, Cục Hải quan Cà Mau đạt 350,84%, Hải quan Quảng Nam đạt 102,85%, Hải quan Bình Phước đạt 138,75% chỉ tiêu thu, Cục Hải quan Quảng Ngãi 107,11%; Cục Hải quan Hà Nam Ninh đạt 128,79%.
Sở dĩ các đơn vị trên vượt chỉ tiêu thu là bởi kim ngạch xuất nhập khẩu (XNK) tại những địa phương này có sự tăng trưởng rõ rệt. Tại Đà Nẵng số thu NSNN là do gia tăng kim ngạch các mặt hàng XNK có thuế, nhất là mặt hàng ô tô NK.
Tại Hải quan Khánh Hòa, số thu NSNN tăng vượt là do yếu tố tác động từ mặt hàng xăng dầu NK, số lượng xăng dầu NK qua cảng Vân Phong tăng cao hơn, điều này đã giúp cho số thu NSNN của đơn vị cũng tăng lên đáng kể và sớm hoàn thành chỉ tiêu thu NSNN.
Tại Cục Hải quan Thừa Thiên Huế, do kim ngạch hàng hóa NK có thuế tăng, trong đó chủ yếu là các dự án đầu tư, linh kiện phụ tùng ô tô và mặt hàng mới là nguyên liệu sản xuất lon bia… Điều này đã giúp cho Hải quan Thừa Thiên Huế sớm hoàn thành chỉ tiêu thu NSNN.
Tuy nhiên, bên cạnh những Cục Hải quan đã vượt chỉ tiêu thu NSNN được giao thì tới thời điểm 25/10/2016 vẫn còn có những Cục đạt số thu rất thấp như: Hải quan Quảng Trị mới chỉ đạt 25,96% chỉ tiêu thu, Hải quan Thanh Hóa mới đạt 30,24%, Hải quan Bình Định đạt 38,66%, Hải quan Hà Tĩnh đạt 31,09%, Hải quan Gia Lai - Kon Tum đạt 31,79%, Hải quan Quảng Bình đạt 39,79%... bởi chịu ảnh hưởng của tình hình XNK trên địa bàn sụt giảm.
Bên cạnh đó, tại một số Cục Hải quan có số thu lớn như TP HCM, Hải Phòng, Hà Nội, Bà Rịa- Vũng Tàu, Hà Nội tỷ lệ thu NSNN cũng chỉ đạt xấp xỉ gần 80%. Cụ thể: Hải quan TP HCM đạt 76,48%, Hải quan Hải Phòng đạt 76,91%, Hải quan Hà Nội đạt 82,08% và Hải quan Bà Rịa -Vũng Tàu do chịu tác động của giá xăng dầu đến nay tỷ lệ thu NSNN mới chỉ đạt 64,81%.
Bước vào giai đoạn đua nước rút, Hải quan các tỉnh, thành phố đều dồn lực tập trung nhiều giải pháp để hoàn thành chỉ tiêu thu NSNN được giao. Tại Cục Hải quan Quảng Ninh đã phát động thi đua “90 ngày đêm nước rút”. Hải quan TP HCM đang triển khai nhiều giải pháp tăng cường hậu kiểm ngay từ cửa khẩu đối với những mặt hàng NK trọng điểm. Tại Cục Hải quan Hà Nội tập trung thực hiện các giải pháp chống thất thu NSNN như: thu hồi và xử lý nợ thuế, công tác thanh tra, kiểm tra…
Trước đó, thống kê của Tổng cục Hải quan cho biết, số thu NSNN của toàn ngành Hải quan trong 9 tháng năm 2016 đạt 194.746 tỷ đồng, bằng 72,13% dự toán và tăng 3,9% so với cùng kỳ năm 2015.