Theo Kết luận thanh tra việc chấp hành quy định của pháp luật về quản lý, sử dụng vốn và tài sản tại Tổng công ty (TCty) lương thực miền Nam (Vinafood 2) và một số đơn vị thành viên vừa được Thanh tra Chính phủ công bố, Tổng Thanh tra Chính phủ kiến nghị xử lý số tiền sai phạm là 205.947,59 triệu đồng và kiểm điểm, xử lý trách nhiệm đối với các cá nhân, đơn vị liên quan đến việc kiểm tra, giám sát, quản lý, sử dụng vốn đối với TCty và các đơn vị thành viên thuộc thẩm quyền, trách nhiệm của Bộ NN&PTNT, Bộ Tài chính.
Bộ NN&PTNT chủ trì phối hợp với Bộ Nội vụ thực hiện kiểm điểm, chỉ đạo kiểm điểm và xử lý theo quy định đối với Hội đồng thành viên, Ban Tổng giám đốc và kiểm soát viên TCty liên quan đến những khuyết điểm, vi phạm trong việc quản lý, sử dụng vốn sai quy định dẫn đến hậu quả kinh doanh thua lỗ, nợ khó đòi, mất vốn nhà nước
TCty kiểm điểm tổ chức chỉ đạo kiểm điểm và xử lý theo quy định các tổ chức, cá nhân liên quan đến những khuyết điểm và vi phạm trong việc quản lý, sử dụng vốn sai quy định với số tiền là 9.920.337,96 triệu đồng và 62.993,174 USD dẫn đến hậu quả kinh doanh thua lỗ, nợ khó đòi, mất vốn nhà nước
Đặc biệt, Tổng Thanh tra kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo Bộ Công an sớm có kết luận điều tra và xử lý đối với 2 vụ việc tại Cty lương thực Vĩnh Long và Cty cổ phần Lương thực Hậu Giang mà Thanh tra Chính phủ đã chuyển hồ sơ sang Bộ Công an từ ngày 24/1/2014. Tiếp nhận hồ sơ từ Thanh tra Chính phủ để điều tra, xử lý đối với các sai phạm trong việc đầu tư góp vốn thành lập Cty cổ phần vận tải biển Hoa Sen của Cty mẹ, làm mất vốn Nhà nước là 22.835,36 triệu đồng.