Liên quan vụ án, Công an TP đã ra quyết định khởi tố bị can, truy nã Nguyễn Trọng Vũ (Giám đốc Cty Đầu tư và Phát triển công nghệ Huy Hoàng, chuyên sản xuất chip) về tội “Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản”. Đến tháng 4/2017, CQĐT tạm đình chỉ điều tra Vũ, khi nào bắt được sẽ xử lý.
Quỹ phát triển KH&CN TP HCM là tổ chức hoạt động không vì mục đích lợi nhuận, có chức năng thúc đẩy ứng dụng kết quả nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ, chuyển giao công nghệ của TP... Hội đồng quản lý của quỹ gồm 6 thành viên do Tân làm Chủ tịch; cơ quan điều hành của quỹ là Quỹ đầu tư phát triển đô thị TP HCM (HIFU).
Cáo trạng xác định, tháng 8/2009, Vũ có công văn gửi Sở KH&CN đề nghị hỗ trợ kinh phí từ ngân sách sự nghiệp khoa học với số tiền 5,1 tỷ để thực hiện Dự án Chip 1. Hội đồng xét duyệt dự án sau đó đã thẩm định và thông qua, đồng ý hỗ trợ cho Cty Huy Hoàng 4,9 tỷ đồng, thời hạn 18 tháng.
Cùng với dự án trên, tháng 9/2009, Vũ tiếp tục có công văn gửi Sở đề nghị vay 10 tỷ đồng để thực hiện dự án 2. Sau các bước thẩm định, xét duyệt, đầu 2010, Tân đã ký văn bản kết luận dự án đạt yêu cầu, đồng ý cho vay dù có nhiều ý kiến phản đối cho rằng dự án không khả thi, đồng thời đề nghị xem xét lại nguồn vốn của Cty Huy Hoàng.
Mấy tháng sau, HIFU ký hợp đồng cho Cty Huy Hoàng vay 10 tỷ đồng, thời hạn 48 tháng, lãi suất 0%, tiến độ giải ngân chia thành nhiều đợt. Sau khi nhận giải ngân đợt 3 ngày 13/5/2011, Vũ xuất cảnh sang Mỹ.
Cáo trạng xác định, tính đến 30/6/2021, Tân và những người liên quan đã gây thiệt hại cho tài sản Nhà nước 22,6 tỷ đồng.
Quá trình điều tra, Tân thừa nhận biết Cty Huy Hoàng còn hạn chế nhưng xét thấy lĩnh vực sản xuất chip điện tử đang được Nhà nước khuyến khích nên ủng hộ. Tân và một số bị can khác không thừa nhận vi phạm vì cho rằng việc xét duyệt cho vay đúng quy định.
