Theo dự báo, từ ngày 13/6, vùng núi Bắc Bộ có mưa rào và dông rải rác, cục bộ có mưa vừa, mưa to với lượng mưa từ 10-20mm, có nơi trên 30mm. Từ chiều tối và đêm ngày 13/6 đến ngày 15/6, ở Bắc Bộ và Bắc Trung Bộ có mưa vừa, mưa to và dông, có nơi mưa rất to. Dự báo lượng mưa tích lũy từ đêm 13/6 đến ngày 15/6 ở Bắc Bộ và Thanh Hóa: phổ biến 40-80mm, có nơi trên 120mm.
Từ đêm 14/6 đến ngày 15/6 khu vực Điện Biên, Lai Châu, Sơn La, Hòa Bình, Nam đồng bằng Bắc Bộ và Thanh Hóa có mưa vừa, mưa to và dông, có nơi mưa rất to với lượng mưa phổ biến 30-60mm, có nơi trên 80mm. Các khu vực khác ở Bắc Bộ có mưa rào và dông, cục bộ có mưa to.
Ban Chỉ đạo quốc gia về phòng chống thiên tai lệnh Công ty thủy điện Sơn La mở tiếp cửa xả đáy thứ 2 vào lúc 14h ngày 13/6; Công ty thủy điện Hòa Bình mở tiếp cửa xả đáy thứ 3 vào lúc 14h và mở cửa xả đáy thứ 4 vào lúc 20h ngày 13/6; Công ty thủy điện Tuyên Quang đóng một cửa xả đáy vào lúc 16h ngày 13/6.
Trung tâm Dự báo khí tượng thủy văn quốc gia thông tin, do ảnh hưởng xả của hồ thủy điện Hòa Bình, mực nước hạ lưu sông Hồng tại Hà Nội sẽ tiếp tục lên nhanh. Trong đợt lũ này, mực nước trên sông Hồng tại Hà Nội có khả năng lên mức 7,5m vào đêm ngày 15/6, dưới BĐ1 2m, sau biến đổi chậm.
Nguy cơ cao xảy ra lũ quét, sạt lở đất và ngập lụt cục bộ tại các tỉnh vùng núi phía Bắc, đặc biệt các tỉnh: Điện Biên, Lai Châu, Sơn La, Hòa Bình, Lào Cai, Yên Bái, Hà Giang, Tuyên Quang, Thái Nguyên, Cao Bằng, Bắc Kạn.
Các thành phố, đô thị như Lào Cai, Điện Biên, Sơn La, Hòa Bình, Thái Nguyên được cảnh báo ngập úng.