Theo quyết định, Trưởng Cơ quan Thường trực là Thứ trưởng Bộ Quốc phòng, Ủy viên thường trực Ban Chỉ đạo.
Các Phó Trưởng Cơ quan Thường trực gồm: Thứ trưởng Bộ Lao động - Thương binh và Xã hội, Ủy viên Ban Chỉ đạo; Thứ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường, Ủy viên Ban Chỉ đạo; Thứ trưởng Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Ủy viên Ban Chỉ đạo; Phó Tổng Tham mưu trưởng Quân đội nhân dân Việt Nam; Phó Chủ nhiệm Tổng cục Chính trị Quân đội nhân dân Việt Nam.
Các Ủy viên Cơ quan thường trực trong Quân đội gồm: Cục trưởng Cục Khoa học quân sự - Bộ Quốc phòng (Ủy viên thường trực); Tư lệnh Binh chủng Công binh - Bộ Quốc phòng; Tư lệnh Binh chủng Hóa học - Bộ Quốc phòng; Thủ trưởng Cục Kế hoạch và Đầu tư - Bộ Quốc phòng; Thủ trưởng Cục Tài chính - Bộ Quốc phòng; Thủ trưởng Cục Đối ngoại - Bộ Quốc phòng; Thủ trưởng Cục Tuyên huấn - Tổng cục Chính trị; Thủ trưởng Cục Bảo vệ an ninh quân đội - Tổng cục Chính trị; Thủ trưởng Cục Chính sách - Tổng cục Chính trị.
Các Ủy viên Cơ quan Thường trực ngoài Quân đội là lãnh đạo cấp tổng cục, cục, vụ thuộc cơ quan: Văn phòng Chính phủ; Bộ Tài nguyên và Môi trường; Bộ Lao động - Thương binh và Xã hội; Bộ Kế hoạch và Đầu tư; Bộ Tài chính; Bộ Công an.
Thư ký Cơ quan Thường trực là cán bộ Văn phòng Bộ Quốc phòng.
Văn phòng Cơ quan Thường trực Ban Chỉ đạo đặt tại Cục Khoa học quân sự - Bộ Quốc phòng; Phó Cục trưởng Cục Khoa học quân sự làm Chánh Văn phòng Cơ quan Thường trực Ban Chỉ đạo.
Cơ quan Thường trực có nhiệm vụ tổ chức nghiên cứu, đề xuất với Trưởng Ban Chỉ đạo phương hướng, nhiệm vụ, giải pháp giải quyết những vấn đề quan trọng, liên ngành; các giải pháp huy động, vận động các nguồn lực trong và ngoài nước để nhanh chóng khắc phục hậu quả bom mìn và chất độc hóa học sau chiến tranh ở Việt Nam; thực hiện vai trò là đầu mối tổng hợp, phối hợp công việc giữa các Thành viên Ban Chỉ đạo và các bộ, ngành, địa phương liên quan.
Tổ chức xây dựng kế hoạch dài hạn, trung hạn và hằng năm để thực hiện chương trình, kế hoạch hành động quốc gia khắc phục hậu quả bom mìn và chất độc hóa học sau chiến tranh; điều phối công tác khắc phục hậu quả bom mìn, chất độc hóa học giữa các bộ, cơ quan ngang bộ, cơ quan thuộc Chính phủ và Ủy ban nhân dân các tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương liên quan trong quá trình thực hiện chương trình, kế hoạch đã được phê duyệt.
Đồng thời, giúp Ban Chỉ đạo đôn đốc các bộ, cơ quan ngang bộ, cơ quan thuộc Chính phủ và Ủy ban nhân dân các tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương liên quan trong việc tổ chức thực hiện những vấn đề liên ngành về khắc phục hậu quả bom mìn, chất độc hóa học sau chiến tranh; tổ chức xây dựng báo cáo thường xuyên, đột xuất về công tác khắc phục hậu quả bom mìn, chất độc hóa học sau chiến tranh ở Việt Nam.
Thủ tướng đồng thời ban hành Quy chế hoạt động của Cơ quan Thường trực Ban Chỉ đạo này. Quy chế này quy định nguyên tắc hoạt động, chế độ làm việc, trách nhiệm, mối quan hệ công tác của Cơ quan Thường trực Ban Chỉ đạo Quốc gia khắc phục hậu quả bom mìn và chất độc hóa học sau chiến tranh ở Việt Nam (Cơ quan Thường trực) được thành lập theo Quyết định số 45/QĐ-BCĐ ngày 9/2/2018 của Trưởng Ban Chỉ đạo.
Trong đó, về nguyên tắc chỉ đạo và điều hành công việc, Cơ quan Thường trực làm việc theo nguyên tắc tập trung thống nhất, các Thành viên chịu trách nhiệm về phần việc được phân công; Trưởng cơ quan Thường trực hoặc người được Trưởng Cơ quan Thường trực ủy quyền quyết định các vấn đề của Cơ quan Thường trực.
Trưởng Cơ quan Thường trực, các Phó Trưởng Cơ quan Thường trực, các Thành viên Cơ quan Thường trực làm việc theo chế độ kiêm nhiệm, thực hiện đầy đủ các nhiệm vụ cụ thể quy định của Quy chế này, được hưởng các chế độ theo quy định của pháp luật; Trưởng Cơ quan Thường trực ủy quyền cho Phó Trưởng Cơ quan Thường trực xử lý những vấn đề cụ thể thuộc lĩnh vực được phân công.
Trưởng Cơ quan Thường trực - Thứ trưởng Bộ Quốc phòng, Ủy viên Thường trực Ban Chỉ đạo quyết định và chịu trách nhiệm trước Trưởng Ban Chỉ đạo, Thủ tướng Chính phủ, Bộ trưởng Bộ Quốc phòng về toàn bộ hoạt động của Cơ quan Thường trực; chỉ đạo toàn bộ các hoạt động của Cơ quan Thường trực, thông qua kế hoạch công tác, chủ trì các cuộc họp của Cơ quan Thường trực; chỉ đạo các hoạt động của Văn phòng Cơ quan Thường trực Ban Chỉ đạo.
Đồng thời giúp Ban Chỉ đạo tổ chức đôn đốc, kiểm tra các bộ, ngành, địa phương, các tổ chức, cá nhân có liên quan thực hiện các chương trình, kế hoạch, nhiệm vụ khắc phục hậu quả bom mìn và chất độc hóa học sau chiến tranh ở Việt Nam.
Các Phó Trưởng Cơ quan Thường trực giúp Trưởng Cơ quan Thường trực điều hành giải quyết các công việc theo chức năng, nhiệm vụ thuộc lĩnh vực quản lý ngành trong khắc phục hậu quả bom mìn và chất độc hóa học sau chiến tranh ở Việt Nam.
Ủy viên Thường trực Cơ quan Thường trực có trách nhiệm tham mưu cho Trưởng Cơ quan Thường trực trong chỉ đạo, giải quyết các mặt công tác của Cơ quan Thường trực; trực tiếp lãnh đạo, chỉ huy, điều hành mọi hoạt động, quản lý cán bộ, trang thiết bị, ngân sách của Văn phòng Cơ quan Thường trực Ban Chỉ đạo.
