Theo thông tin từ chi nhánh vận tải Đường sắt Hải Phòng, sau sự cố tàu hàng đâm vào cầu Quay tối ngày 6/7 đã làm biến dạng, hư hỏng một phần đường sắt, ảnh hưởng đến tuyến giao thông đường sắt Hải Phòng - Hà Nội. Ngay trong đêm, các lực lượng chức năng và đơn vị liên quan đã nhanh chóng vào cuộc khắc phục sự cố.
Các lực lượng nhanh chóng kết hợp, khẩn trương khắc phục hậu quả.
Khoảng 7h sáng ngày 7/7, đơn vị thi công đã khắc phục xong nhịp 1 (nhịp nặng nhất), còn nhịp 2 đến 9h ngày 7/7 đơn vị sửa chữa cơ bản hoàn thành và bắt đầu căn lại đường sắt. 10h40, ga Hải Phòng và Chi nhánh Vận tải đường sắt Hải Phòng đã cho tàu chạy thử để các cơ quan chuyên môn đánh giá và cho phép thông cầu. Tàu thử tải về ga Hải Phòng lúc 10h55 an toàn nguyên vẹn.
11h00, Chi nhánh Vận tải đường sắt Hải Phòng thông báo các tàu hoạt động bình thường trở lại, tất cả các tàu xuất phát và kết thúc tại ga Hải Phòng. Xe đạp, xe máy nhận vận chuyển tại ga Hải Phòng (không nhận ga Thượng Lý).
Trước đó, vào khoảng 19h30 ngày 6/7, tàu vận tải hàng hóa mang biển số đăng ký NB-6450 do thuyền trưởng Trần Văn Định, sinh năm 1972, đăng ký thường trú tại Lưu Phương, Kim Sơn (tỉnh Ninh Bình) điều khiển đang di chuyển từ sông Lạch Tray vào sông đào Hạ Lý, khi tới gầm cầu Quay thì xảy ra va chạm giữa cabin lái và bố cầu.
Vụ va chạm khiến cầu Quay bị biến dạng, ray đường sắt bị lệch, phương tiện thủy bị hư hỏng phần khoang lái. Phương tiện thuỷ NB-6450 có công suất máy 450 mã lực, thời điểm va chạm lượng hàng trên phương tiện là 1472,4 tấn, trọng tải toàn phần 1502 tấn.