Theo đó, HĐXX gồm 5 người (2 thẩm phán và 3 hội thẩm nhân dân). Ba kiểm sát viên của VKSND tối cao và VKSND TP Hà Nội được phân công thực hành quyền công tố và kiểm sát xét xử sơ thẩm tại phiên tòa.
Trong vụ án này, bị cáo Trần Tùng (SN 1978, cựu PGĐ Sở Ngoại vụ Thái Nguyên) bị xử về tội "Nhận hối lộ" và "Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
Năm bị cáo bị xử về tội "Nhận hối lộ" gồm: Trần Thị Quyên (SN 1986, GĐ Cty Sen vàng Đất Việt); Lê Thị Phượng (SN 1969, cựu chuyên viên Phòng Khoa giáo Văn xã, Văn phòng UBND tỉnh Hải Dương); Nguyễn Văn Văn (SN 1965, cựu PGĐ Sở Y tế Quảng Nam); Lê Ngọc Tường (SN 1979, cựu PGĐ Sở VH,TT&DL Quảng Nam); Nguyễn Mạnh Trường (SN 1980, cựu Chuyên viên Phòng Vận tải hàng không, Cục Hàng không, Bộ GTVT).
Có 10 bị cáo bị xét xử về tội "Đưa hối lộ" gồm: Vũ Hồng Quang (SN 1977, cựu Phó Phòng Vận tải hàng không); Trần Thanh Nhã (SN 1991, ngụ TP HCM); Vũ Hoàng Dũng (SN 1987, ngụ Hà Nội); Nguyễn Mạnh Cương (SN 1977, Trưởng phòng Thương mại điện tử, Cty CP Thương mại hàng không Vietjet); Đặng Nhật Đức (SN 1975, GĐ Cty TNHH Top Agent Japan); Bùi Đăng Khoa (SN 1984, GĐ Cty TNHH MTV Du ngoạn thế giới); Trương Thị Mỹ Dung (SN 1972, GĐ Cty TNHH MTV Thương mại Dịch vụ Du lịch Ánh Sao Thiên); Phạm Quốc Thắng (SN 1977, GĐ Cty TNHH PNR); Trần Thị Ngân (SN 1984, Chủ tịch Hội đồng quản trị Cty TNHH Thương mại và Dịch vụ Anna Travel), Trần Minh Phụng (SN 1970, GĐ Cty TNHH Thương mại Dịch vụ du lịch và Xây dựng Gia Huy).
Riêng bị cáo Nguyễn Xuân Thông (SN 1975, ngụ Hà Nội) bị xét xử về tội "Che giấu tội phạm".
Theo cáo trạng, khi dịch Covid-19 bùng phát và diễn biến phức tạp, Chính phủ đã chỉ đạo tổ chức các chuyến bay đưa công dân Việt Nam từ nước ngoài về nước để phòng, chống dịch.
Lợi dụng chủ trương và chức vụ, quyền hạn được giao, một số cá nhân tại UBND các tỉnh, thành đã thỏa thuận đưa/nhận hối lộ, làm trái công vụ để tham mưu, đề xuất chấp thuận chủ trương cho các DN đưa công dân về nước cách ly y tế tại địa phương.
Các bị cáo còn trực tiếp hoặc qua trung gian móc nối, thỏa thuận với cán bộ thuộc Bộ Y tế đưa hối lộ/nhận hối lộ với số tiền lớn để có văn bản chấp thuận, xét duyệt cho công dân (khách lẻ) về trên các chuyến bay đơn lẻ.
Ngoài ra, có bị cáo lợi dụng vị trí công tác hướng dẫn, xúi giục người liên quan khai báo gian dối, che giấu tội phạm, gây cản trở việc điều tra, làm rõ tội phạm của cơ quan chức năng.
Cụ thể, Trần Tùng đã nhận hối lộ 3 lần với tổng số tiền hơn 4,4 tỷ đồng. Bị cáo Tùng còn lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ, làm trái công vụ để tham mưu, đề xuất UBND tỉnh Thái Nguyên trong việc thực hiện 7 chuyến bay của Bùi Thị Kim Phụng, hưởng lợi hơn 3,2 tỷ đồng.
Nguyễn Văn Văn đã nhận hối lộ 5 lần, tổng số tiền 450 triệu đồng. Lê Ngọc Tường đã nhận hối lộ 4 lần, tổng số 400 triệu đồng. Nguyễn Mạnh Trường nhận hối lộ 4 lần, tổng số 244 triệu đồng…
Đối với Nguyễn Xuân Thông, cáo trạng nêu rõ bị cáo Thông không hứa hẹn trước nhưng khi biết Trần Minh Tuấn (đã bị xử lý ở giai đoạn 1 của vụ án) có hành vi đưa hối lộ mà vẫn hướng dẫn Tuấn khai báo gian dối để che giấu hành vi phạm tội.
Hành vi của bị cáo Thông bị VKSND tối cao xác định là đã gây cản trở việc điều tra, truy tố, xét xử vụ án "Đưa hối lộ, Nhận hối lộ, Môi giới hối lộ, Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ, Lừa đảo chiếm đoạt tài sản" xảy ra tại Bộ Ngoại giao, Hà Nội và các tỉnh, thành khác (vụ án "chuyến bay giải cứu" giai đoạn 1).
