Ngày 3/12/2008 Công ty Cổ phần Xây lắp và Vật tư xây dựng 3 (Cty Xây lắp 3) do Ngô Văn Mười làm Chủ tịch Hội đồng quản trị kiêm Giám đốc và Công ty TNHH Thương mại Sản xuất Kinh doanh vật liệu xây dựng Cần Thơ (Cty Xây dựng Cần Thơ) do Lê Hoàng Phương làm Giám đốc có ký hợp đồng mua bán về việc cung cấp vật liệu xây dựng (VLXD).
Theo đó, Cty Xây dựng Cần Thơ bán cho Cty Xây lắp 3 các loại VLXD phục vụ công trình Kho bạc Nhà nước Cần Thơ có giá trị 6 tỷ đồng.
Phương thức thanh toán là sau khi ký hợp đồng, Công ty Xây lắp 3 sẽ tạm ứng cho Công ty Xây dựng Cần Thơ 50% giá trị hợp đồng để làm cơ sở giữ giá cố định, khi giao nhận đủ hàng hóa sẽ thanh toán số tiền còn lại.
Ngày 10/4/2009, sau khi Phòng Kế hoạch kỹ thuật Cty Xây lắp 3 đề nghị thanh toán theo hợp đồng, ông Mười ký ủy nhiệm cho Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam chuyển 3 tỷ đồng từ Cty Xây lắp 3 vào tài khoản Cty Xây dựng Cần Thơ.
Sau khi chuyển tiền, do cần tiền thanh toán các nguồn nợ cá nhân, ông Mười điện thoại cho ông Phương nói dối là: hiện Cty Xây lắp 3 đang gặp khó khăn về tài chính nên tạm ứng số tiền chênh lệch bằng tiền mặt trên số tiền vừa chuyển để giải quyết công việc của Cty Xây lắp 3.
Vì thế ông Phương cho Mười nhận lại 1,7 tỷ đồng sau khi đối chiếu số lượng vật tư đã cung cấp cho Công ty Xây lắp 3 có giá trị khoảng 1,3 tỷ đồng.
Để hợp thức hóa về thủ tục, ông Phương cho soạn sẵn hợp đồng (không số) điều chỉnh lại số tài khoản ngân hàng và phương thức thanh toán...Sau khi nhận 1,7 tỷ, ông Mười không nhập vào quỹ tiền mặt của công ty, không báo cáo, không bàn bạc mà tự ý sử dụng để trả nợ vay cá nhân hơn 1,3 tỷ đồng. Số tiền còn lại, ông Mười chi cho hoạt động của công ty ...
Ngày 08/02/2010, Công ty Xây lắp 3 tiếp tục chuyển 200 triệu đồng để thanh toán tiền vật tư cho Công ty Xây dựng Cần Thơ theo hợp đồng. Đến tháng 10/2012, Công ty Xây lắp 3 (lúc này Trần Văn Thảo làm Giám đốc) và Công ty Xây dựng Cần Thơ giải quyết công nợ theo hợp đồng ngày 03/12/2008, thống nhất Công ty Xây lắp 3 đã nhận hàng hóa với giá trị gần 1, 7 tỷ đồng và đã chuyển trả cho Công ty Xây dựng Cần Thơ 3,2 tỷ đồng.
Tuy nhiên, hai bên không thống nhất về công nợ. Cty Xây lắp 3 cho rằng đã chuyển trả còn thừa hơn 1,5 tỷ đồng. Còn Cty Xây dựng Cần Thơ thì cho rằng Cty Xây lắp 3 còn nợ hơn 186 triệu đồng do ông Mười đã nhận lại 1,7 tỷ đồng.
Sau đó, Mười thừa nhận có lấy 1,7 tỷ đồng từ Cty Xây dựng Cần Thơ và cam kết sẽ trả lại số tiền đó cho Cty Xây lắp 3 nhưng không thực hiện nên ông Thảo có đơn tố cáo ông Mười đến cơ quan điều tra.
Qua xem xét hồ sơ vụ án, lời khai của bị cáo và người có nghĩa vụ liên quan tại phiên tòa, HĐXX nhận định bị cáo đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn tự ý sử dụng tiền là trái với quy định. Vì thế, HĐXX đã nhất trí với VKS chuyển tội danh đối với bị cáo là “Sử dụng trái phép tài sản”.