Theo đó, nội dung báo cáo nêu: Trước kia, đền thờ Lê Văn Hưu (hay còn gọi là chùa ông Hưu) có quy mô rộng lớn, cây cối um tùm, có hồ, có giếng, có gác chuông. Tuy nhiên, sau cải cách, tiền đường đã bị dỡ để làm một căn nhà tách biệt ở bên cạnh đền làm nơi họp hành làng, xã và làm một nơi đón tiếp khách về viếng thăm. Như vậy, lý lịch di tích Đền thờ Lê Văn Hưu được ghi là có hồ, có giếng (không có Giếng Ngọc). Căn cứ vào hồ sơ khoa học di tích, Đền thờ Lê Văn Hưu được Bộ Văn hoá (nay là Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch) công nhận di tích lịch sử quốc gia vào tháng 3/1990, có hạng mục giếng và chưa có tài liệu nào chứng minh giếng của Đền thờ Lê Văn Hưu là giếng cổ nghìn năm.
Cũng theo nội dung báo cáo, ngày 26/12/2018, Chủ tịch UBND tỉnh có Quyết định số 5293/QĐ-UBND; ngày 11/3/2019, UBND huyện Thiệu Hoá ban hành Quyết định số 795/QĐ-UBND về việc phê duyệt dự án đầu tư xây dựng công trình: Tu bổ, tôn tạo khu di tích lịch sử Đền thờ Lê Văn Hưu, xã Thiệu Trung với quy mô và nội dung đầu tư gồm 9 hạng mục và chia làm 3 giai đoạn. Trong đó giai đoạn 3: Hồ sơ thiết kế bản vẽ thi công Dự án tu bổ, tôn tạo di tích lịch sử Đền thờ Lê Văn Hưu gồm các hạng mục công trình: Nhà từ đền, nhà bia, cổng sang chùa, am hóa vàng, giếng ngọc, ao đền, bình phong, bãi đỗ xe, khuôn viên, hạ tầng kỹ thuật, được HĐND huyện Thiệu Hoá phê duyệt chủ trương tại Nghị quyết số 95/NQ-HĐND ngày 07/10/2021.
Ngày 29/12/2021, Cục Di sản văn hoá có văn bản số 1104/DSVH-DT về việc thẩm định thiết kế BVTC tu bổ, tôn tạo di tích đền thờ Lê Văn Hưu (giai đoạn 3) tỉnh Thanh Hoá, trong đó lưu ý: “Điều chỉnh vị trí thiết kế Giếng Ngọc để hạn chế tối đa việc dịch chuyển giếng theo lưu ý của Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch tại công văn số 1840/BVHTTDL-DSVH ngày 13/6/2011”; ngày 30/12/2021, Sở Văn hoá, Thể thao và Du lịch tỉnh Thanh Hóa có văn bản số 5514/SVHTTDL-DSVH gửi UBND huyện Thiệu Hoá tiếp thu, chỉnh sửa, bổ sung và hoàn thiện hồ sơ thiết kế BVTC tu bổ, tôn tạo di tích Đền thờ Lê Văn Hưu (giai đoạn 3).
Theo Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch Thanh Hóa, sau khi báo chí phản ánh, ngày 17/3/2022, Sở đã phối hợp với UBND huyện Thiệu Hoá, UBND xã Thiệu Trung, Hội Khoa học lịch sử Thanh Hoá và các nhà nghiên cứu di tích, lịch sử kiểm tra thực tế tại di tích Đền thờ Lê Văn Hưu. Tuy nhiên, tại hội nghị còn có những ý kiến trái chiều giữa các nhà quản lý, các nhà nghiên cứu văn hoá, khoa học, lịch sử và địa phương. Vì vậy, trước mắt Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch đã có văn bản đề nghị Chủ tịch UBND tỉnh Thanh Hóa chỉ đạo UBND huyện Thiệu Hóa tạm dừng việc thi công hạng mục Giếng Ngọc.
Tuy nhiên, để kịp thời phục vụ Lễ kỷ niệm 700 năm ngày mất của nhà Sử học Lê Văn Hưu vào ngày 23/4/2022, Sở Văn hoá, Thể thao và Du lịch Thanh Hoá đề nghị Cục Di sản Văn hoá sớm tổ chức vào kiểm tra thực tế và có ý kiến chỉ đạo cụ thể để địa phương và Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch có cơ sở triển khai thực hiện các bước tiếp theo đảm bảo đúng quy định.
