Như PLVN đã thông tin, dự án trên thực hiện đã hơn 18 năm, bước đầu hình thành hạ tầng kỹ thuật khung giai đoạn 1 và một số công trình đã đưa vào sử dụng; nhưng về tổng thể chưa mang lại hiệu quả đầu tư, chưa đáp ứng được mục tiêu dự án. Nếu tình trạng này không được khắc phục thì dự án sẽ tiếp tục kéo dài gây lãng phí ngân sách.
Theo KTNN, dự án QG-HN02, tính đến thời điểm kiểm toán mới triển khai đầu tư, hoàn thành được 16,7/43,5km đường giao thông (36,7%), 7/11 cầu trên tuyến (63,6%); 33,4/64,2km hệ thống thoát nước mưa (52%); 1227,9km đường ống cấp nước (43%); 10/19,7km đường ống thoát nước thải (50,7%); khoảng 100/140km cáp ngầm chiếu sáng (71,4%).
Dự án QG-HN07 mới hoàn thành được công trình Khoa Toán- Cơ tin học (HT1), đang thi công dở dang Khoa Vật lý (HT2). Trung tâm Nano & Năng lượng, trung tâm khoa học vật liệu mới (NCI) và sân vườn, cảnh quan ngoài nhà ZONE 4 chưa triển khai. Công trình Khoa Toán - Cơ tin học (HTI) đã thi công xong nhưng chưa có đường dây cấp điện cấp nước nên chưa đủ điều kiện nghiệm thu bản giao đưa vào sử dụng.
Dự án QG-HN05 được phê duyệt gồm 5 khu ký túc xá sinh viên có tổng diện tích sàn xây dựng là 471.500m2 để phục vụ cho 41.000 sinh viên với mục đích đến năm 2015 sẽ hoàn thành đưa vào sử dụng nhằm xây dựng và phát triển ĐHQG Hà Nội thành một trung tâm đào tạo đại học, sau đại học, nghiên cứu và ứng dụng khoa học - công nghệ đa ngành, đa lĩnh vực chất lượng cao, làm nòng cốt cho hệ thống giáo dục đại học Việt Nam. Tuy nhiên đến thời điểm kiểm toán dự án mới chỉ hoàn thành xây dựng và đưa vào sử dụng Khu ký túc xá số 4 với các hạng mục nhà D2, D3, D4, D5.
Cùng hoàn cảnh, Dự án QG-HN06 mục tiêu là phục vụ ăn ở sinh hoạt cho các giáo sư, giảng viên trong và ngoài nước khi đến tham gia giảng dạy hợp tác nghiên cứu khoa học theo các kế hoạch hợp tác đào tạo của các trường trong ĐHQG Hà Nội cũng như có thể kinh doanh phục vụ các đối tượng khác trong thời điểm chưa sử dụng hết công suất. Tuy nhiên, nhà công vụ số 1 - QG-HN06 đã đưa vào sử dụng nhưng chưa đồng bộ với các dự án thành phần khác, chưa đáp ứng được mục tiêu đầu tư.
Từ kết quả kiểm toán, KTNN đề nghị ĐHQG xử lý tài chính theo kết quả kiểm toán số tiền hơn 8,2 tỷ đồng, giảm thanh toán hơn 3,6 tỷ đồng, giảm trừ giá trị hợp đồng còn lại số tiền hơn 3,4 đồng tương ứng giá trị sai khối lượng chưa nghiệm thu thanh toán, xử lý khác số tiền hơn 26 tỷ đồng.
KTNN cũng kiến nghị BQL dự án phối hợp Trung tâm Phát triển Quỹ đất huyện Thạch Thất đẩy nhanh tiến độ giải phóng mặt bằng (GPMB) dự án phục vụ thi công. Đặc biệt là những gói thầu đang thi công dở dang không thi công được tiếp tục do vướng mặt bằng. Làm rõ nguyên nhân trách nhiệm của các bên liên quan trong việc chậm tiến độ thực hiện các hợp đồng để xử lý đúng quy định;
Khẩn trương giải quyết triệt để những tồn tại liên quan đến số liệu về chi phí xây dựng cơ bản dở dang được nhận bản giao từ các BQL dự án thời kỳ ĐHQG làm chủ đầu tư (năm 2008 trở về trước).
KTNN cũng kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo ĐHQG Hà Nội chủ trì phối hợp với bộ, ngành, địa phương đánh giá tổng thể dự án và đề xuất phương án thực hiện trong thời gian tới, nhằm sớm đưa dự án vào hoạt động. Chỉ đạo Bộ KH&ĐT, Bộ Tài chính bố trí vốn cho dự án và xem xét cho phép triển khai một số hạng mục công trình thiết yếu mới của dự án. Chỉ đạo UBND Hà Nội phối hợp ĐHQG Hà Nội giải quyết dứt điểm công tác GPMB cho dự án.
