Theo xác minh ban đầu, những người có liên quan đến việc điều tra, truy tố, xét xử để xảy ra việc oan sai đối với ông Huỳnh Văn Nén bao gồm:
Đại tá Nguyễn Kiến Quốc ( nguyên Phó Giám đốc Công an tỉnh Bình Thuận); Thượng tá Đinh Kỳ Đáp ( nguyên Phó Phòng Cảnh sát điều tra, Phó Thủ trưởng Cơ quan cảnh sát điều tra); Thiếu tá Nguyễn Quang Bảng (nguyên điều tra viên); Thiếu tá Nguyễn Hữu Tỉnh (nguyên cán bộ Phòng Cảnh sát Điều tra Công an Bình Thuận); bà Nguyễn Thị Hồng Dung ( nguyên Viện trưởng Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Bình Thuận); ông Huỳnh Văn Phương ( nguyên cán bộ Viện kiểm sát nhân dân tỉnh Bình Thuận); ông Đinh Văn Lai ( cán bộ Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Bình Thuận); ông Vũ Hồ Thành (cán bộ Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Bình Thuận); ông Nguyễn Ngọc Quang ( nguyên Chánh án Tòa án nhân dân tỉnh Bình Thuận); ông Phan Gia Báu ( nguyên thẩm phán Tòa án nhân dân tỉnh Bình Thuận) và hai hội thẩm nhân dân là ông Phan Tấn Khế và ông Nguyễn Đẩu.
Trước đó, ngày 17/5/1998, cơ quan CSĐT, Công an tỉnh Bình Thuận bắt tạm giam ông Huỳnh Văn Nén (sinh năm 1962, quê Cà Mau, trú tại thôn 2, Tân Minh, Hàm Tân, Bình Thuận) vì nghi ông Nén là thủ phạm giết bà Bông ở thôn 2 xã Tân Minh, huyện Hàm Tân (Bình Thuận) vào đêm 23/4/1998.
Ngày 31/8/2000, tại phiên tòa sơ thẩm, ông Nén khai do bị bức cung, nhục hình nên buộc phải khai nhận tội giết bà Bông để cướp chiếc nhẫn 1 chỉ vàng. Tuy nhiên TAND tỉnh Bình Thuận tuyên phạt ông Huỳnh Văn Nén tù chung thân vì tội giết bà Bông. Ông Nén sau đó không biết làm đơn kháng cáo nên bản án sơ thẩm có hiệu lực pháp luật.
Một diễn biến khác trước đó, trong quá trình điều tra, điều tra viên còn buộc ông Nén khai nhận đã cùng nhiều người của gia đình vợ giết bà Dương Thị Mỹ ở cùng thôn vào đêm 18/5/1993.
Từ lời khai này, cơ quan CSĐT, Công an tỉnh Bình Thuận phục hồi điều tra vụ bà Mỹ bị giết, khởi tố ông Huỳnh Văn Nén và 9 người trong gia đình vợ ông. Ông Nén bị tuyên phạt 6 năm tù. Vụ án này sau đó trở nên nổi tiếng với tên gọi “Vụ án vườn điều”. Sau đó, các bị cáo trong vụ án này đã được đình chỉ điều tra, trả tự do, được các cơ quan pháp luật xin lỗi công khai và được bồi thường oan sai. Riêng ông Nén không được bồi thường, tiếp tục thụ án tù chung thân tại vụ án bà Bông.
Trở lại vụ án giết bà Bông, ngày 2/9/2000, Nguyễn Phúc Thành, trú tại Tân Minh, đang thụ án về tội cố ý gây thương tích tại trại giam Sông Cái ở Ninh Thuận nghe tin ông Nén có thể bị kết án tử trong vụ giết bà Bông. Do biết rõ hai người bạn thân của mình mới là thủ phạm nên Thành làm đơn tố giác gửi ban giám thị trại giam.
Nội dung đơn tố giác của Nguyễn Phúc Thành được trại giam Sông Cái chuyển cho Cục V26 - Bộ Công an. Sau đó Cục V26 chuyển cho Công an Bình Thuận xem xét. Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Bình Thuận lại cử điều tra viên vụ án giết bà Bông đi xác minh. Đơn tố giác nói trên sau đó rơi vào im lặng.
Sau khi một số luật sư vào cuộc và báo chí đồng loạt lên tiếng, tháng 9/2014, VKSND Tối cao kháng nghị tái thẩm vụ án rồi TAND Tối cao hủy án để điều tra lại. Chiều 22/10/2015, ông Nén được cho tại ngoại sau 17 năm 5 tháng ngồi tù./.
