Các khu công nghiệp đều có trạm xử lý nước thải tập trung (PLVN) - Các khu công nghiệp (KCN) ở tỉnh Phú Yên đều có các công trình xử lý nước thải tập trung đã được thiết lập và vệ sinh đảm bảo các quy định về môi trường.