Theo Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Phú Yên, khi đang là Giám đốc Sở Tài chính, ông Đỗ Duy Vinh đã tham mưu cho ông Phạm Đình Cự, Chủ tịch UBND tỉnh Phú Yên trước đây ký Thông báo số 13/TB-UBND ngày 7/1/2013 cho phép Công ty CP Pymepharco chuyển nhượng quyền sử dụng đất thửa số 76, tờ bản đồ số 8, ô phố A2 đường Hùng Vương, phường 5, TP Tuy Hòa thuộc trường hợp nhà nước phải thu hồi. Hành vi này là trái pháp luật, gây thất thoát tài sản nhà nước hơn 10 tỷ đồng.
Lật lại hồ sơ thửa đất nêu trên, được biết vào ngày 25/5/2007, UBND tỉnh Phú Yên có quyết định phê duyệt, giao khu đất nêu trên có diện tích 1.183m2 cho Công ty CP Pymepharco (đã cổ phần hóa, Nhà nước giữ 51% vốn điều lệ) trong 70 năm, mức thu tiền sử dụng đất hơn 3,57 tỷ đồng.
Hơn 5 năm kể từ khi được giao đất, Công ty CP Pymepharco không xây dựng một hạng mục nào. Do đó, Sở Kế hoạch và Đầu tư Phú Yên có văn bản kiến nghị UBND tỉnh chấm dứt hiệu lực dự án để có cơ sở thu hồi đất theo quy định.
Thế nhưng, trên cương vị Chủ tịch UBND tỉnh Phú Yên lúc bấy giờ, ông Phạm Đình Cự không chỉ đạo thực hiện, Sở Tài Nguyên và Môi trường cũng không kiểm tra, thanh tra việc sử dụng đất của chủ đầu tư dự án để kiến nghị thu hồi đất theo quy định pháp luật.
Việc làm trên là trái với quy định của pháp luật tại khoản 12 Điều 38 Luật Đất đai 2003, khoản 2, Điều 55 Luật Đầu tư 2005 và khoản 3, Điều 2, Quyết định số 1714/QĐ-UBND ngày 18/9/2007 của UBND tỉnh Phú Yên, gây thất thoát tài sản Nhà nước với số tiền hơn 10 tỷ đồng.
Hiện, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Phú Yên đang tiếp tục mở rộng điều tra, làm rõ vai trò, hành vi phạm tội của một số đối tượng khác có liên quan để xử lý theo quy định pháp luật.