Sai phạm này xảy ra trong quá trình Bộ Công Thương tham mưu cho Thủ tướng ban hành quy định về diện đối tượng và điều kiện được hưởng chính sách giá điện ưu đãi, kết luận điều tra nêu.
Bảy cựu cán bộ bị đề nghị truy tố với vai trò đồng phạm gồm: Nguyễn Danh Sơn, cựu Giám đốc Cty Mua bán điện EVN; 3 cựu nhân viên Nguyễn Hữu Khải, Đỗ Ngọc Tuyền, Trương Hoàng Dũng; Trần Quốc Hùng, Phó phòng Cấp phép và Quan hệ công chúng, Cục Điều tiết Điện lực, Bộ Công Thương; Trịnh Văn Đoàn, nhân viên của Hùng; Phan Văn Sang, cán bộ thuộc Phòng Thanh tra, cục Thuế Bình Phước.
Ba cựu cán bộ thuộc Cục Thuế Bình Phước là Nguyễn Duy Khánh, cựu Phó Cục trưởng; Trần Văn Định, cựu Trưởng phòng và Phạm Quang Vinh, cựu Phó phòng bị đề nghị truy tố về tội Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng.
Để phục vụ quá trình điều tra bổ sung, Bộ Công an cho biết đã xác minh, thu thập tài liệu tại nhiều cơ quan tổ chức. Trong đó, Bộ Công an đề nghị EVN thống kê số tiền EVN đã thanh toán cho Nhà máy điện mặt trời Solar Farm Nhơn Hải, do Cty CP Đầu tư năng lượng tái tạo LICOGI 16 Ninh Thuận làm chủ đầu tư và Nhà máy điện mặt trời Trung Nam - Thuận Nam, do Cty TNHH Điện mặt trời Trung Nam Thuận Nam làm chủ đầu tư đến ngày CQĐT khởi tố vụ án (28/6/2023).
CQĐT đề nghị EVN tính số tiền chênh lệch trong trường hợp hai nhà máy nêu trên được áp dụng mức giá mua điện là 7,09 US cents/kWh kể từ ngày vận hành thương mại đến ngày 28/6/2023.
Bộ Công an yêu cầu Cty CP Đầu tư và Quản lý nguồn điện Việt Nam giải trình, cung cấp thông tin, tài liệu về vai trò, trách nhiệm với dự án Nhà máy điện mặt trời Lộc Ninh 1, 2, 3, 4, 5.
Bộ Công an cũng yêu cầu Cty Mua bán điện, Trung tâm điều độ hệ thống điện Quốc gia, Cty CP Hệ thống kỹ thuật ứng dụng ATS (phát triển, thiết kế và xây dựng các giải pháp phục vụ hoạt động điều khiển, bảo vệ và quản lý hệ thống điện) cung cấp các hồ sơ, tài liệu, giấy phép... liên quan đến các dự án của Cty Lộc Ninh.
Một trong những nội dung của vụ án là vấn đề hoàn thuế sau quy định. Theo KLĐT, tháng 10 - 12/2020, Cty Cổ phần Năng lượng Lộc Ninh 3 hoàn thành đầu tư xây dựng và vận hành thương mại Nhà máy điện mặt trời Lộc Ninh 3 tại Bình Phước trên diện tích hơn 149ha đất rừng sản xuất thuộc quyền sử dụng của Cty TNHH MTV Cao su Lộc Ninh.
Diện tích này không được các cơ quan thẩm quyền ra quyết định thu hồi, giao, cho thuê và chuyển mục đích sử dụng đất rừng sản xuất sang đất công trình năng lượng; không được cấp phép xây dựng; không được ra quyết định chủ trương đầu tư. Do đó, việc Cty CP Năng lượng Lộc Ninh 3 đầu tư, xây dựng dự án Nhà máy điện mặt trời Lộc Ninh 3 tại xã Lộc Tấn, huyện Lộc Ninh đã vi phạm Luật Đầu tư.
Tháng 4/2021, Cty Lộc Ninh 3 gửi hồ sơ đề nghị Cục Thuế Bình Phước hoàn trả hơn 145 tỷ đồng tiền thuế GTGT từ việc đầu tư, xây dựng dự án trên và sau đó được hoàn trả 145 tỷ đồng, dù không thuộc trường hợp được hoàn thuế.
Ba bị can tại Cục Thuế bị cáo buộc liên quan sai phạm hoàn thuế này. Hơn 145 tỷ đồng được Bộ Công an tính là thiệt hại cho ngân sách nhà nước.
CQĐT xác định, để xảy ra thiệt hại, bị can Nguyễn Duy Khánh, cựu Phó Cục trưởng phụ trách Phòng Thanh tra - Kiểm tra 3, có vai trò, trách nhiệm tổ chức, chỉ đạo thực hiện kiểm tra, giải quyết hoàn thuế và duyệt ký quyết định hoàn thuế.
Quá trình duyệt ký Quyết định hoàn thuế GTGT cho Cty Lộc Ninh 3, "vì thiếu trách nhiệm", Khánh đã "thực hiện không đầy đủ, không đúng nhiệm vụ được giao", dẫn đến không phát hiện trong hồ sơ đề nghị hoàn thuế của Cty này không bảo đảm thủ tục pháp lý, không đủ điều kiện được hoàn thuế. Khánh ký ban hành quyết định cho Lộc Ninh 3 được hoàn thuế trái luật.
Tương tự, Trần Văn Định, cựu Trưởng phòng Phòng Thanh tra - Kiểm tra 3 và Phạm Quang Vinh, cựu Phó Trưởng phòng Phòng Nghiệp vụ - Dự toán - Pháp chế thuộc Cục Thuế cũng bị cáo buộc "vì thiếu trách nhiệm", đã thực hiện không đầy đủ, không đúng nhiệm vụ, không phát hiện được những “lỗ hổng” trong hồ sơ của Lộc Ninh 3, dẫn đến DN được hoàn thuế sai hơn 145 tỷ đồng.
Cùng với 937 tỷ đồng trong sai phạm liên quan Vượng, Kim, tổng thiệt hại trong vụ án là hơn 1.082 tỷ đồng.
CQĐT cho hay, đến thời điểm ra kết luận điều tra, 7 bị can đã nộp khắc phục hậu quả tổng 1,78 tỷ đồng.
