Cơ quan điều tra cũng đề nghị truy tố Nguyễn Quốc Tuấn (SN 1975, cựu Phó trưởng phòng Tài nguyên và Môi trường huyện Thanh Thủy) về tội “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong thi hành công vụ”, Phùng Duy Thuấn (SN 1976, cựu Thủ quỹ Hội đồng bồi thường GPMB huyện Thanh Thủy) và Vũ Hồng Phương (SN 1986, cựu Kế toán Hội đồng bồi thường GPMB huyện Thanh Thủy) cùng về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”.
Theo kết luận điều tra, tháng 10/2015, tỉnh Phú Thọ phê duyệt dự án đầu tư cải tạo, nâng cấp đường giao thông kết nối quốc lộ 32 và đường Hồ Chí Minh với quốc lộ 70B tỉnh Phú Thọ đi Hoà Bình, tổng mức đầu tư giai đoạn 1 là hơn 200 tỷ đồng.
Bị can Nguyễn Văn Hoà, khi đó là Phó Chủ tịch huyện Thanh Thủy, được giao nhiệm vụ Trưởng Ban quản lý dự án, Chủ tịch Hội đồng bồi thường GPMB huyện. Đến năm 2018, Hội đồng bồi thường GPMB đã chi trả gần 90 tỷ đồng tiền bồi thường, nhưng bị can Hòa đã không chỉ đạo nhân viên lập sổ sách kế toán theo dõi, chứng từ thu chi về số tiền trên.
Cựu Phó Chủ tịch UBND huyện Thanh Thủy còn giao nhiều cá nhân quản lý trái quy định rồi chỉ đạo nhân viên dưới quyền rút tiền cho mình sử dụng cá nhân, gây thiệt hại hơn 40 tỷ đồng.
Để che giấu hành vi chiếm đoạt tài sản của mình, trong các hội nghị công tác và báo cáo tiến độ dự án, bị can Hoà đều khai báo gian dối về thực trạng công tác bồi thường giải phóng mặt bằng. Khi UBND huyện Thanh Thuỷ yêu cầu trình bày, bị can Hoà vẫn báo cáo sai sự thật và chỉ đến khi vụ việc bị phát giác mới thừa nhận sai phạm.
Bị can Nguyễn Quốc Tuấn, khi đó là Phó phòng Tài nguyên và Môi trường, giữ cương vị Phó Chủ tịch Hội đồng bồi thường GPMB huyện Thanh Thuỷ, đã chỉ đạo cấp dưới rút tiền tạm ứng chi trả bồi thường giải phóng mặt bằng nhưng không lập quỹ tiền mặt, không quản lý theo dõi. Tuấn đã nhiều lần đưa tiền cho bị can Hoà với tổng số gần 31 tỷ đồng từ quỹ của dự án.
Ngoài ra, bị can Tuấn còn lập hồ sơ thanh toán, tạm ứng khống việc chi trả tiền bồi thường cho 32 hộ dân, gây thiệt hại cho nhà nước hơn 300 triệu đồng. Số tiền này, bị can Tuấn khai đã chi tiếp khách, quà ngày lễ...
Trong khi đó, Phùng Duy Thuấn - Thủ quỹ Hội đồng bồi thường GPMB huyện Thanh Thủy - đã 13 lần lấy tiền từ nguồn tạm ứng để đưa cho bị can Hòa với tổng số tiền gần 10 tỉ đồng. Dù bị can Hòa có chỉ đạo đưa tiền, không có phiếu chi, không rõ mục đích sử dụng, nhưng Thuấn không kiểm tra mà vẫn làm theo.
Còn Vũ Hồng Phương trong thời gian làm Kế toán Hội đồng bồi thường GPMB huyện Thanh Thủy đã ký 22 giấy tờ để rút hơn 33 tỉ đồng và ký 23 phiếu thu tạm ứng tiền nhưng đã không lập sổ sách theo dõi, giám sát chi tiết từng khoản theo nghiệp vụ kế toán. Hành vi thiếu trách nhiệm của Phương tạo điều kiện cho bị can Hòa chiếm đoạt hơn 40 tỉ đồng ngân sách nhà nước.