Theo đó, qua kết quả thanh tra Dự án xây dựng BVĐK Vĩnh Thạnh, ngoài những kết quả đạt được, UBND huyện Vĩnh Thạnh (chủ đầu tư), BQLDA và các nhà thầu tư vấn, nhà thầu thi công còn để xảy ra nhiều thiếu sót, vi phạm các quy định về quản lý sử dụng đất, các quy định trong đầu tư xây dựng.
Thanh tra TP Cần Thơ kết luận, đối với việc cho thuê 4.302,2m2 đất làm sân bóng, UBND huyện Vĩnh Thạnh cho cá nhân thuê không qua đấu giá là trái quy định tại Điều 58 Luật Đất đai năm 2003. Khi hết thời hạn cho thuê vào tháng 3/2016, UBND huyện không thu hồi lại hoặc quản lý mà vẫn để cá nhân thuê đất sử dụng kinh doanh, không nộp tiền thuê. Số tiền chưa nộp vào ngân sách là gần 59 triệu đồng. Chịu trách nhiệm chính cho việc này là Phó Chủ tịch UBND huyện và Giám đốc Trung tâm phát triển quỹ đất giai đoạn 2012-2016. Thanh tra kiến nghị thu hồi lại phần đất đang cho thuê kinh doanh sân bóng đá mi ni, đồng thời quản lý, khai thác sử dụng phải đúng theo quy định.
Đối với gói thầu san lấp mặt bằng, hàng rào, nhà bảo vệ, theo Thanh tra, Nhà thầu lập hồ sơ dự thầu áp dụng hệ số chi phí chung và thu nhập chịu thuế tính trước là không phù hợp, thực hiện khối lượng không đúng với hồ sơ thiết kế được duyệt. Trách nhiệm thuộc về Giám đốc BQLDA, cán bộ kỹ thuật và HTX Xây dựng Công Bình.
Bên cạnh đó, nhiều gói thầu thi công bệnh viện cũng bị phát hiện có nhiều sai phạm. Đối với gói thầu khối nhà chính dãy A, B và cầu nối, Thanh tra TP Cần Thơ kiến nghị thu hồi của Công ty Cổ phần Đầu tư xây dựng Bất động sản Hiệp Hòa Phát với tổng số tiền hơn 1 tỉ đồng. Ngoài ra, đề nghị Công ty Cổ phần Đầu tư xây dựng Bất động sản Hiệp Hòa Phát phải hoàn trả nộp ngân sách Nhà nước kinh phí của dự án với tổng số tiền hơn 4,6 tỉ đồng; thu hồi của Công ty Cổ phần Tư vấn ĐTXD Cần Thơ tiền chi phí giám sát phần phát sinh tăng ốp gạch, phát sinh giảm matit, sơn do xác định lại theo giá trị khối lượng ốp gạch của nhà thầu thi công với số tiền hơn 7,3 triệu đồng; thu hồi của Công ty TNHH xây dựng Ngân Hùng với tổng số tiền hơn 272 triệu đồng.
Do có dấu hiệu vi phạm pháp luật về đầu tư xây dựng, Thanh tra TP Cần Thơ kiến nghị chuyển hồ sơ 5 gói thầu qua Công an TP Cần Thơ để tiếp tục điều tra, làm rõ gồm: Gói thầu khối nhà chính dãy A, B và cầu nối; gói thầu khối nhà chính dãy C, D và các hạng mục phụ trợ; gói thầu hệ thống xử lý nước thải, thiết bị; gói thầu lò đốt rác; việc chỉ định thầu tư vấn lập dự toán và thẩm tra dự toán các gói thầu thiết bị có dấu hiệu vi phạm pháp luật, gây thiệt hại cho ngân sách nhà nước hơn 413 triệu đồng.
Ngoài ra, Thanh tra TP Cần Thơ kiến nghị các cơ quan có liên quan tổ chức kiểm điểm, quy trách nhiệm và có hình thức xử lý kỷ luật nghiêm đối với cá nhân thuộc thẩm quyền quản lý, do có thiếu sót, sai phạm. Đồng thời các tổ chức, cá nhân khắc phục những thiếu sót, sai phạm đã nêu.