Theo hồ sơ vụ án, năm 2013 và 2014, cơ quan Cảnh sát điều tra Công an TP Hà Nội nhận được đơn của nhiều người tố cáo bà Mai có hành vi lừa đảo chiếm đoạt tài sản.
Vào cuộc điều tra, cơ quan chức năng xác định giai đoạn năm 2009 đến 2013, bà Mai giữ chức vụ Chủ tịch HĐQT. Từ năm 2010, do làm ăn thua lỗ, không có khả năng trả nợ nên bà Mai đã dùng nhiều thủ đoạn khác nhau để lừa đảo, chiếm đoạt tài sản của nhiều người trên địa bàn TP Hà Nội.
Thủ đoạn mà bà Mai sử dụng là hứa hẹn xin cấp giấy phép thay đổi quy sử dụng đất xây dựng chung cư, xin giấy phép xây dựng nhà, thỏa thuận vay vốn vay vốn để được mua căn hộ tại dự án Tổ hợp chung cư cao tầng và dịch vụ khu đất N04- Khu đô thị Đông Nam, quận Cầu Giấy (viết tắt là dự án N04).
Sau khi nhận tiền của các bị hại, Nguyễn Phương Mai không thực hiện như cam kết mà chiếm đoạt hết.
Cụ thể, năm 2008, UAC liên danh với UDIC, CTCP Đầu tư xây dựng công nghiệp (ICC) và CTCP thương mại quốc tế và tư vấn đầu tư (Invecon) để thực hiện dự án N04. Trong đó UAC góp 25% vốn. Dự án được phê duyệt xây dựng với tổng mức đầu tư 2.070 tỷ đồng.
Ngày 7/9/2011, Đại hội đồng cổ đông của UAC mới ban hành Nghị quyết thông qua việc vay vốn để đầu tư dự án. Mặc dù HĐQT công ty không có chủ trương huy động vốn bên ngoài nhưng bị cáo Mai đã lợi dụng danh nghĩa Chủ tịch HĐQT tự ý lập, ký thỏa thuận vay vốn, hợp đồng huy động vốn với các cá nhân bên ngoài. Bị cáo còn lập các phiếu thu giả, giấy nhận tiền, giấy nhận cọc, giả chữ ký kế toán, thủ quỹ trên các phiếu thu để chiếm đoạt hơn 26,3 tỷ đồng của 13 người.
Số tiền trên, Mai không đưa vào hệ thống sổ sách quản lý, không nhập tiền vào quỹ công ty mà sử dụng chi tiêu cá nhân.
Quá thời hạn cam kết, 13 khách hàng không mua được nhà, đề nghị được rút tiền nhưng bị cáo lẩn tránh. Đến khi làm việc với công ty, họ mới biết toàn bộ giấy tờ là giả mạo nên tố cáo sai phạm của nữ chủ tịch HĐQT.
Ngoài hành vi trên, bị cáo còn chiếm đoạt số tiền gần 628 triệu đồng của bà Trần Thị Lan H. nhờ xin thay đổi quy hoạc và mục đích sử dụng đất xây dựng chung cư, chiếm đoạt 1 tỷ đồng của bà Bùi Thị Mỹ H. để xin thay đổii giấy phép xây dựng nhà.
Cơ quan chức năng xác định tổng số tiền bị cáo chiếm đoạt của 15 bị hại là hơn 27,9 tỷ đồng.
Với hành vi nêu trên, bà Mai bị tuyên phạt tù chung thân về tội “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản”. Về trách nhiệm dân sự, HĐXX tuyên buộc bị cáo phải hoàn trả số tiền trên cho các nạn nhân.