Theo cáo trạng, Hùng đã có vợ, con, cuối tháng 8/2016, anh ta bị TAND quận Cầu Giấy (Hà Nội) xử phạt 20 tháng tù về tội “Tàng trữ trái phép chất ma túy”. Sau khi ra trại trở về địa phương sinh sống, Hùng nhanh chóng quen rồi nảy sinh tình cảm với Phạm Hà Trang Huyền – cô gái kém anh ta 15 tuổi. Cả hai thuê nhà sống với nhau như vợ chồng.
Tài liệu điều tra thể hiện, sáng 18/1/2018, đội Cảnh sát điều tra tội phạm về ma túy – Công an quận Đống Đa phối hợp với Công an phường Ngã Tư Sở và đội CSGT số 14 phát hiện, bắt quả tang Nguyễn Mạnh Hùng cùng Ngô Văn Duy đang có hành vi vận chuyển trái phép chất ma túy. Tại đây, lực lượng chức năng thu giữ trong khoang để bánh phụ cốp phía sau xe hàng chục túi nilon đựng ma túy tổng hợp với khối lượng gần 2,1 kg. Theo lời khai của Hùng, đây là ma túy được anh ta và Duy mang từ Nghệ An ra Hà Nội bán. Khám xét khẩn cấp nơi ở của Hùng và Huyền, lực lượng chức năng thu giữ thêm được một ít ma túy loại ketamine, cân điện tử và đĩa sứ đều có ma túy.
Quá trình điều tra xác định khoảng tháng 8/2017, Nguyễn Mạnh Hùng quen biết và “đầu quân” cho một đối tượng buôn ma túy có tên thường gọi là Đá sống tại Lào. Hùng từng nhiều lần vận chuyển ma túy từ Nghệ An ra Hà Nội cho Đá. Mỗi chuyến trót lọt, anh ta được Đá trả công từ 30 triệu đến 50 triệu đồng/lần.
Ngày 17/1/2018, Hùng tiếp tục nhận được điện thoại của Đá bảo vào Nghệ An chuyển ma túy ra Hà Nội để giao cho khách của Đá. Nhận lời, Hùng rủ Duy đi cùng. Rạng sáng cùng ngày, Hùng lái ô tô, chở Duy tới gần cửa khẩu Cầu Treo (Hà Tĩnh) nhận ma túy. Sáng hôm sau cả hai đem ma túy ra Hà Nội. Khi đi đến thị trấn Văn Điển (Thanh Trì, Hà Nội) thì bị lực lượng công an liên ngành phát hiện, bắt giữ quả tang.
Ngoài việc giúp Đá bán ma túy cho khách của Đá, Hùng còn cất giấu ma túy tại nơi anh ta và Huyền thuê ở để làm hàng mẫu và bán lại kiếm lời. Ngô Văn Duy (bạn Huyền) và Huyền biết Hùng giấu ma túy tại phòng ngủ, giúp Hùng bán ma túy. Bên cạnh đó, Huyền còn xin của Hùng một ít ma túy để bán cho người khác.
Cơ quan chức năng xác định, Nguyễn Mạnh Hùng phải chịu trách nhiệm về hành vi nhiều lần mua bán trái phép chất ma túy với khối lượng hơn 2,2 kg, Ngô Văn Duy phải chịu trách nhiệm về hành vi giúp sức cho Hùng mua bán khoảng 2,2kg ma túy. Riêng Huyền phải chịu trách nhiệm hình sự về việc nhiều lần giúp sức cho chồng hờ mua bán hơn 12,4 gam ma túy.
Với hành vi trên, sau khi nghị án, HĐXX TAND TP Hà Nội tuyên phạt bị cáo Hùng và Duy cùng mức án tử hình về tội “Mua bán trái phép chất ma túy”, riêng Huyền bị tuyên phạt 8 năm tù cùng về tội danh này.