Theo đó, ngày 16/1/2018, TAND tỉnh bắc Ninh đã mở phiên tòa xét xử bị cáo Nguyễn Trọng Phương (SN 1980, trú ở phường Phúc Xá, Ba Đình, Hà Nội) về tội “Đe dọa giết người”.
Trước đó, bị cáo Phương bị truy tố về tội “Khủng bố”, sau nhiều lần hoãn tòa, tội danh của bị cáo Phương thay đổi sang tội “Đe dọa giết người”, theo khoản 2, Điều 103-BLHS năm 1999.
Theo bản cáo trạng truy tố, Nguyễn Trọng Phương và vợ đối tượng vốn mở Công ty TNHH Song Lộc (gọi tắt là Công ty Song Lộc) với nhiều ngành nghề kinh doanh, trong đó có ngành nghề kinh doanh vật liệu xây dựng và khai thác cát sỏi.
Qua mối quan hệ xã hội, Phương quen biết, đồng thời từng hợp tác làm ăn với anh Ngô Thành Sơn (SN 1980) – Chủ tịch HĐQT Công ty Trục vớt luồng hạ lưu và Trần Anh Thuận (SN 1981) – Phó giám đốc Công ty CP Xuất nhập khẩu và vận tải Khánh Nguyên.
Khoảng tháng 9/2015, Công ty Song Lộc đề nghị UBND tỉnh Bắc Ninh cho phép được nạo vét thanh thải và tận thu sản phẩm trên sông Đuống (từ Km 03 đến Km 14), thuộc xã Cao Đức đến xã Đại Lai (huyện Gia Bình) và tại xã Đào Viên (huyện Quế Võ) nhưng không được UBND tỉnh bắc Ninh chấp thuận.
Tuy nhiên, trong thời điểm này Phương thấy công ty của anh Sơn vẫn được cấp phép hoạt động trên sông Cầu, thuộc địa phận tỉnh Bắc Giang nên nảy sinh lòng ghen ghen đố kỵ.
Sau đó, Phương nảy sinh ý đồ nhắn tin đe dọa đồng chí Nguyễn Tử Quỳnh, Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh và đồng chí Giám đốc Công an tỉnh Bắc Ninh với mục đích nếu các đồng chí lãnh đạo tỉnh Bắc Ninh lo sợ thì doanh nghiệp Phương sẽ được cấp phép khai thác cát trên sông Đuống. Bằng không thì công ty của anh Sơn sẽ bị gây khó khăn.
Để thực hiện hành vi phạm tội, Phương bàn bạc, đồng thời chỉ đạo Thuận mua điện thoại và sim rác để nhắn tin đe dọa lãnh đạo tỉnh Bắc Ninh. Nhằm tránh bị phát giác, Phương dặn Thuận là nhắn tin xong phải hủy bỏ ngay vật chứng và đến gần nhà anh Sơn để thực hiện tội phạm.
Vài ngày sau, Phương hỏi lại Thuận về việc nhắn tin đe dọa lãnh đạo tỉnh Bắc Ninh thì được anh này nói qua quýt là “đã sai đàn em làm rồi”. Tuy nhiên thực tế, Thuận không dám thực hiện kế hoạch mà Phương đưa ra.
Nghi ngờ Thuận chưa nhắn tin đe dọa Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh, chiều 23/1/2017, Phương lái ô tô đến huyện Văn Giang (Hưng Yên) và rủ người em họ đi chơi cùng.
Trên đường đi, Phương bảo em họ lái ô tô chở sang Bắc Ninh, đồng thời gọi cho vợ để cập nhật số điện thoại của Chủ tịch tỉnh Bắc Ninh và Giám đốc Công an tỉnh Bắc Ninh.
Đến tối cùng ngày, Phương ngồi ở một quán nước gần cổng Bệnh viện Đa khoa tỉnh Bắc Ninh dùng sim, điện thoại “rác” nhắn liên tiếp 10 tin nhắn đe dọa tới số điện thoại của đồng chí Nguyễn Tử Quỳnh – Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh trong đó có tin nhắn liên quan đến vụ lãnh đạo tỉnh Yên Bái bị sát hại ngay tại phòng làm việc trước đó để tạo sức nặng.
Trên đường từ Bắc Ninh về Hà Nội, Phương vứt bỏ chiếc điện thoại vừa nhắn tin đe dọa lãnh đạo tỉnh Bắc Ninh xuống sông phi tang.
Đến ngày 16/3/2017, Phương nhắn tin thông báo cho Thuận rằng mình đã thực hiện việc đe dọa hai lãnh đạo của tỉnh Bắc Ninh.
Sau đó, Cơ quan CSĐT – Công an tỉnh Bắc Ninh đã bắt giữ được Phương sau 15 ngày vào cuộc điều tra.
Trong vụ án này, Trần Anh Thuận cũng bị đề cập xử lý về tội “Không tố giác tội phạm”. Tuy nhiên, do cơ quan tố tụng thay đổi tội danh từ tội “Khủng bố” sang tội “Đe dọa giết người” đối với Phương nên Trần Anh Thuận không bị xử lý hình sự.